Seleção de primers para análise de inter simple sequence repeats (ISSR) em Cereus sp. (Cactaceae)

Resumo

O objetivo no presente estudo foi selecionar primers e padronizar reações de PCR (Polymerase Chain Reaction) para analisar ISSR (Inter SimpleSequenceRepeats), em futuros estudos de variabilidade genética em plantas do gênero Cereus, popularmente conhecidas como mandacaru. Os marcadores ISSR são considerados promissores para análise molecular uma vez que anelam em regiões específicas do genoma (interlocos SSR) e os segmentos de DNA são amplificados por reações simples, produzindo um padrão reprodutivo de segmentos amplificados. Os primers ISSR-1, ISSR-3, ISSR-4, ISSR-5, ISSR-7, ISSR-8, ISSR-11, ISSR-12, ISSR-15, ISSR-16, ISSR-813, ISSR-825, ISSR-UBC-808, ISSR-17898A e ISSR-17898B foram selecionados, por apresentarem bandas (sequências de DNA) nítidas em gel de agarose 1,7% quando submetidos à eletroforese, usando uma temperatura para ligação dos primers de 49°C na PCR. O número médio de sequências amplificadas por primer foi de 10,58 e o primer ISSR-4 gerou o maior número de sequências (18) ISSR, enquanto o primer ISSR-1 produziu o menor número (4) de sequências. Os primers selecionados no presente estudo, poderão ser utilizados para analisar a diversidade genética em ISSR entre as espécies do gênero Cereus de diferentes regiões do Brasil.